孙序徐序沈序卷一华佗论病理神方一○○一·论人法与天地一○○二·论阴阳大要一○○三·论生成一○○四·论阳厥一○○五·论阴厥一○○六·论阴阳痞格一○○七·论寒热一○○八·论虚实大要一○○九·论上下不宁一○
类中肝风眩晕头痛咳嗽吐血失音肺痿虚劳遗精淋浊尿血小便闭癃
自序凡例卷上寒总论肾虚人易犯伤寒论不服药为中医论两感论时行疫症伤寒十六症类伤寒六症内伤外感辨治伤寒宜早视伤寒宜详辨成氏再传之讹六经七日病愈论仲景三百九十七法一百一十三方论陶氏辨差认十六条察色法察目法察
序小引揉积论综概晒说跋
概述卷一阴阳颠倒篇顺逆探原篇回天生育篇天人寿夭篇命根养生篇救母篇红铅损益篇初生微论篇骨阴篇卷二媾精受妊篇社生篇天厌火衰篇经脉相行篇经脉终始篇经气本标篇脏腑阐微篇考订经脉篇包络配腑篇卷三胆腑命名篇任督死
《神农本草经》简介邵序张序孙序周序上经（上品）玉石丹沙云母玉泉石钟乳涅石消石朴消滑石石胆空青曾青禹余粮太乙余粮白石英紫石英青石、赤石、黄石、白石、黑石脂等白青扁青草菖蒲鞠华人参天门冬甘草干地黄术菟丝子
铜人针灸经点校说明卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七
子总论（第一）药性（第二）升药加减（第三）降药加减（第四）升药良方（第五）降药良方（第六）自拟表降备用方（第七）半表半降良方（第八）误降再表方（第九）后（第十）小便赤涩（十一）大便秘结（十二）泄泻（十
弁言杨序总评卷上卷下书《人身图说》后书《医林改错》后书《医林改错》后读《全体新论》
脏腑虚实标本用药式