卷之一上草部（山草类）人参珠儿参会兰参潞党参西洋参东洋参高丽参北沙参桔梗甘草葳蕤黄精黄蓍白术苍术天麻秦艽柴胡银州柴胡前胡川独活川独活川独活川独活北细辛远志金毛狗脊淫羊霍巴戟天琐阳肉苁蓉肥白芨参三七地榆
徐序刘序朱子跋郭长阳医书自序卷一伤寒名例十问叙论五问治法大要九问伤寒脉法及刺法六问张仲景华元化五问卷二仲景辨脉法三十八条卷三仲景平脉法四十五条卷四六经统论二十二问太阳经证治上九十五条卷五太阳经证治下九
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
叙卷一肿疡（谓疮疡未出脓者）溃疡(谓疮疡已出脓者)溃疡作痛卷二溃疡发热(附恶寒)发背脑疽卷三鬓疽时毒(谓毒发于面鼻耳项)疔疮臀痈(附腿痈并腿痛香港脚)卷四脱疽肺痈肺痿肠痈卷五瘰流注疮疡作渴作呕卷六咽喉
序自序续序凡例卷之上痧症发蒙论玉衡要语痧分表里辨治痧宜看凉热唇舌辨大小便宜通咽喉治法治痧当绝其根痧原论治痧当分经络痧与杂症轻重不同治痧三法痧前禁忌痧后禁忌痧胀凶症痧为百病变症医家当识痧筋放痧有十放痧须
卷一/太阳篇上辨列太阳条例大意太阳正治法第一太阳病脉证三条桂枝汤脉证七条桂枝汤禁三条麻黄汤脉证七条合病证治六条辨伤寒受病阴阳不同一条太阳病愈时日及欲解之候与传经之证六条太阳权变法第二不可发汗例十条桂枝
石山医案
内容提要生理学合参卷一一、西医生理学脑血液皮肤消化器循环器呼吸器排泻器神经系五官器生殖器二、中医生理学五脏六腑此外病理学合参卷二一、热二、痛三、血四、呕吐五、谵语六、泻七、肿，胀八、汗九、头痛十、咳嗽
原序上卷胎前总论恶阻胎动不安胎动腹痛胎漏下血漏胎跌扑动胎小便带血子淋子肿子满子悬子烦子嗽子疟子痫子喑外感风寒霍乱吐泻下痢热症因怒满闷小腹重坠作痛小腹虚胀闭滞胎冷腹痛欲泻胎惊心悸气促胀痛不安头眩目晕痰壅
叙卷上伤寒论难读并宜补大旨三阳三阴分经名义伤寒重病多是下焦伏寒伏寒触发与伤寒时温脉证并病机异同即病伏气直中传经四证异同晚发是伤寒正病两感有三水气凌心即是三焦伤伤寒杂病皆有之无端暴喘即是寒入命门伤寒杂病