叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
断死证秘诀秘受不治法受伤治法通用方秘传方附录验方四则
傅青主女科歌括
序卷一跌打损伤小引看伤有治无治之论秘传下手口诀治周身口诀损伤秘传口诀秘传接骨口诀效方开后秘传要旨总论秘传损方药名十二咏卷二总论卷三跌打水药歌观音针（一点一针）雷火针九龙针太乙救苦针又麻药方附录经验杂方
潘序黄序王序马评汤序马评吴序自序凡例重订凡例卷一痈疽总论部位论名烂溃不敛患孔毒根翻花起肛毒瓦斯攻心阴症门阴疽论阴疽治法流注甲疽井泉疽瘰小肠疽鹤膝风横乳岩贴骨疽骨槽风恶核痰核石疽善头鹅掌风鹅爪风冻疮阴疽
正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
序一序二序三总论伤寒热病总论验舌色论验口唇论验二便论辨脉论南北方宜发表不同论南北方宜清里相同论三阴经热病论三阴经寒病论阴症似阳论阳症似阴论宜发表论忌发表论宜清里论忌清里论宜和解论忌和解论宜吐法论忌吐法
简介武进阳湖合志序卷一 水部卷二 火部卷三 土部卷四 五金部卷五 石部卷六 卤石部卷七 山草部卷八 芳草部卷九 隰草部卷十 毒草部卷十一 蔓草部卷十二 水草部卷十三 石草部卷十四 谷部卷十五 菜部卷十
序卷之一五绝死第一虚劳第二诸风第三伤寒时疫第四中诸毒第五诸虫蛇伤第六头痛第七咽喉第八心病第九腹痛第十腰痛第十一疝气第十二诸气第十三香港脚第十四水蛊第十五痰嗽第十六胃病呕噎第十七诸血第十八消渴第十九霍乱
序退思集类方歌注麻黄汤类麻黄汤麻黄加术汤麻黄杏仁甘草石膏汤麻黄杏仁薏苡甘草汤越脾汤越脾加术汤越脾加半夏汤大青龙汤小青龙汤小青龙加石膏汤甘草麻黄汤麻黄附子汤麻黄附子细辛汤麻黄连翘赤小豆汤麻黄升麻汤浓朴麻