自序序论脏象论经络次序论经络浅深论奇经八脉论总论宗气论营气论卫气论脉诀论病因论中风论八风论轻重论寒热论证候论风脉论治法论药饵附案
自序赵序辛序凡例卷之一·杂症脏腑说心包络三焦说五脏配五行八卦说水火说命门说五脏生克说五邪说十二经配三阳三阴说六气说六气后论运气说虚实寒热说补泻论反治论标本说表里论阴阳论夏月伏阴辨气气之病证脉治法血吐血
序重刻序卷一升降部围药部内消部内护部卷二化毒部点头部拔毒部去腐部止痛部生肌收口部去管部膏药部卷三疔疮部喉症部诸疮部卷四疮部癣疮部痔疮部口牙部鼻耳部脚部补遗
卷一十二经循行部位歌头前正面歌头后项颈歌胸腹脊背图手膊臂外内歌足膝外内歌肺经歌大肠经歌胃经歌脾经歌心经歌小肠经歌膀胱经歌肾经歌心包络经歌三焦经歌胆经歌肝经歌任脉歌督脉歌脉诀十二经气血多少歌痈疽总论歌痈
《汤液本草》序一《汤液本草》序二《汤液本草》后序卷之一五脏苦欲补泻药味脏腑泻火药东垣先生药类法象用药法象药性要旨气味浓薄寒热阴阳升降图（缺）升降者天地之气交用药升降浮沉补泻法五味所用药类法象标本阴阳论
第1部分第2部分
万氏家传养生四要
序论痘疹受病之由论痘疹治法类集痘疹已效名方附方附：
《雷公炮炙论》序上卷朱砂云母钟乳白矾硝石芒硝滑石曾青太一禹余粮黄石脂黄精菖蒲人参天门冬甘草干地黄菟丝子牛膝葳蕤防葵柴胡独活升麻车前草木香薯蓣薏苡仁泽泻远志龙胆细辛石斛巴戟天黄连络石蒺藜子黄肉苁蓉蒲黄续
自序经脉肺手太阴之脉手太阴肺经图肺经诸穴歌又分寸歌大肠手阳明之脉手阳明大肠经图大肠经诸穴歌又分寸歌胃足阳明之脉足阳明胃经图胃经诸穴歌又分寸歌脾足太阴之脉足太阴脾经图脾经诸穴歌又分寸歌心手少阴之脉手少阴