自序卷一脉法察舌要言四家异同重药轻投辩同病各发中风中络中经中腑中脏口眼斜半身不遂中风僵卧中风僵卧中风僵卧中风僵卧中寒真心痛厥心痛直中少阴直中厥阴直中厥阴暑热湿刚痉柔痉伤暑中暑伤热伤湿呕吐泄泻霍乱转筋发
神农本草经赞
论治法论伤各要害处不治论用药论各穴要害之处论验轻重伤诀论用药要诀论各伤主方
弁言序调经门总论精血论养血论调气论辨色论多少论先期后期论居经论泄泻论身痛论痛经论经漏论不利论过期论经闭论枯血论血劳论血崩论痰气污血论杀血心痛论带下论白浊白淫论虚劳门冷劳热劳骨蒸劳血风劳胎前门总论胎前调
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
张序卷首保产卷一禀赋脏能脉候胎病胎热胎寒胎肥胎怯胎黄胎惊锁肚不啼不乳脐风撮口噤口变蒸卷二杂症咽喉齿舌口耳目鼻囟颐脐语迟夜啼龟胸龟背鹤节行迟五软五硬卷三痘疮总诀卷四痘疮发热三日诀见点三日诀卷五痘疮起胀三
脉学阐微
刻针灸问对叙序卷之上卷之中三才法候气法十四法卷之下十五络脉歌周身经穴相去分寸歌肺经大肠经胃经脾经心经小肠经肾经膀胱经心包络经三焦经胆经肝经督脉任脉经穴起止歌十二经纳支干歌天心十一穴歌经脉交会八穴歌八会
叙卷之一咽喉大纲论喉舌分经说咽喉看治法总要十六绝症又四绝症右手图左手图针穴图卷之二精选应用诸方（九方）制药法（四法）爰采应用诸方（十二方）卷之三咽喉门第一（十一症图说）帘珠喉呛食哑喉内外肿喉风热喉紫色
妇科总括卷一调经门天癸月经之原妇人不孕之故月经之常月经异常外因经病内因经病不内外因经病血色不正病因气秽清浊病因愆期前后多少经行发热时热经行寒热身痛经行腹痛经行泻吐错经妄行成吐衄崩经水过多兼时下白带调经