叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
绪 言第一章 经络总论一、经络的组成和作用二、经络的标本、根结、气街、四海三、经络的生理功能和临床应用第二章 腧穴总论一、腧穴的发展、分类和命名二、腧穴的作用三、特定穴的意义和特点四、腧穴的定位第三章
序一序二序三例言卷上疡证总论疡科调治心法略义申明外疡实从内出论辨脑疽对口论脑疽后论辨百会疽玉枕疽论辨夭疽锐毒虚实论辨大头瘟抱头火丹毒论辨鬓疽额疽论辨凤眉疽眉心疔眉发论辨眼丹眼漏论辨眼胞菌毒眼胞痰核论辨
断死证秘诀秘受不治法受伤治法通用方秘传方附录验方四则
自序卷之一痈疽之源（一）痈疽之别（二）脉法（三）分经络（四）善恶（五）虚实（六）内消（七）内托（八）灸（九）针烙（十）砭镰（十一）敷贴(十二）淋洗（十三）将护（十四）禁忌（十五）肿疡(十六)发表辛凉解
秘传外科方
新刻《儒门事亲》序重刊《儒门事亲》序《儒门事亲》后序卷一七方十剂绳墨订一指风痹痿厥近世差玄说二立诸时气解利禁忌式三疟非脾寒及鬼神辩四小儿疮丹瘾疹旧蔽记五证妇人带下赤白错分寒热解六霍乱吐泻死生如反掌说七
肠痈急劳走马牙疳西法化验倒视痧秽宜嚏、过饱宜吐痧症、鼠疫寒包暑热久咳、风温咳风寒二便不通神昏谵语（一）用药分量胎黄鼻衄湿温、疝气、风疹、热入血室、阳明经白虎证、天花、时气肝气为湿热所遏 痘不化浆神昏谵
劝读十则
原序卷之一一·条令二·检覆总说上三·检覆总说下四·疑难杂说上卷之二五·疑难杂说下六·初检七·覆检八·验尸九·妇人附·小儿尸并胞胎十·四时变动十一·洗罨十二·验未埋瘗尸首十三·验坟内及屋下攒殡尸十四·验