序叙自序卷之一·述古卷之二·论治瘟疫名义论疫病有三种论用党参宜求真者论治瘟疫慎用古方大寒剂论用大黄石膏芒硝论立方用药论疫症繁多论治疫症最宜变通论抄复论仅读伤寒书不足以治瘟疫不读伤寒书亦不足以治瘟疫论读
卷上卷下
卷一活幼指南赋慈幼敬心赋卷二小儿总治法小儿初生脐风小儿变蒸小儿胎疾小儿五脏部位五脏外症看小儿虎口纹脉法小儿夜啼惊风吐泻痢疾小儿疟疾咳嗽疳痨伤食伤风浮肿口疮疥疮染症五脏外症五软病症卷三水镜诀指掌形图入门
序内消法一艾灸法二神火照法三刀针砭石法四围药法五开口除脓法六收口法七总论服药法八详论五善七恶救援法九将息法十外科症治方药发背脑疽鬓疽井口疽疔疮喉痹缠喉风缠舌喉风乳蛾舌衄悬痈（一）腮痈喉疮走马牙疳喉瘤茧
序卷之一脉经序学诊例总论脉式三部分位六经所属五脏所属五脏本脉体六经本脉体五脏传变病脉六经中伤病脉五用乖违病脉脉偶名状七表病脉八里病脉九道病脉卷之二太医习业五科凡例纪用备论脏腑配天地论三因论外所因论叙中
洄溪医案
环周图说难上卷本输穴说难手太阴肺经五穴一、少商（井穴）二、鱼际（荥穴）三、大渊（俞穴）四、经渠（经穴）五、尺泽（合穴）手阳明大肠经六穴一、商阳（井穴）二、二间（荥穴）三、三间（俞穴）四、合谷（原穴）五
叙四诊初生门惊风门痫证门疳证门呕吐门泻证门感冒风寒门瘟疫门暑证门霍乱门痢疾门疟疾门咳嗽门喘证门痰证门疝证门淋证门头痛门腹痛门黄胆门水肿门腹胀门发热门癖疾门汗证门失血门杂证门幼科证治汇方
序自序凡例卷一医中百误歌保生四要治阴虚无上妙方人参果医有彻始彻终之理内伤外感致病十九字火字解脉法金针寒热虚实表里阴阳辨医门八法论汗法论和法论下法论消法论吐法论清法论温法论补法伤寒纲领伤寒主治四字论经腑
诊余举隅录